In Pokémon Schwert reist man durch die Galar-Region, um Pokémon zu fangen und Pokémon-Kämpfe zu bestreiten. Zusammen mit seinem Rivalen Hop beginnt der Spieler seine Reise und möchte Pokémon-Champion werden.
Auf dem Weg durch die Region muss man acht Arenaleiter besiegen und ihre Orden sammeln. Dabei entdeckt man immer mehr über die legendären Pokémon Zacian und Zamazenta. Gleichzeitig bedroht eine mysteriöse Energie die Galar-Region. Der Präsident der Liga, Rose, versucht, diese Energie zu nutzen, verursacht dadurch aber eine große Gefahr.

Am Ende muss der Spieler die Bedrohung aufhalten und gemeinsam mit Hop die legendären Pokémon retten. Danach tritt man im großen Finale gegen den amtierenden Champion Delion an. Wenn man ihn besiegt, wird man selbst zum neuen Champion der Galar-Region.